Ο Μητροπολίτης Αρσένιος Καρδαμάκης γεννήθηκε το 1973 στην Γέργερη. Αποφοίτησε από την Ριζάρειο Εκκλησιαστική Σχολή και από την Ανωτέρα Εκκλησιαστική Σχολή Αθηνών. Σπούδασε στο Τμήμα Θεολογίας της Θεολογικής Σχολής του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών και στο Τμήμα Κανονικού Δικαίου του Πανεπιστημίου του Στρασβούργου. Πραγματοποίησε μεταπτυχιακές σπουδές στον Τομέα της Αγίας Γραφής και της Πατερικής Γραμματείας του Τμήματος Ποιμαντικής και Κοινωνικής Θεολογίας της Θεολογικής Σχολής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και στον Τομέα της Πατερικής Γραμματείας στο Πανεπιστήμιο του Στρασβούργου.
Εκάρη Μοναχός από τον Μητροπολίτη Γορτύνης & Αρκαδίας Κύριλλο και χειροτονήθηκε Διάκονος από τον Αρχιεπίσκοπο Κρήτης Τιμόθεο, το 1998, στην Ιερά Μονή Αγίου Γεωργίου Επανωσήφη. Χειροτονήθηκε Πρεσβύτερος και χειροθετήθηκε Αρχιμανδρίτης από τον τότε Επίσκοπο Κνωσού και νυν Μητροπολίτη Γορτύνης & Αρκαδίας Μακάριο, το 2002. Το 2007, έλαβε το οφφίκιο του Αρχιμανδρίτη του Οικουμενικού Θρόνου.
Από το 1999 έως το 2004, υπηρέτησε στην Ιερά Μητρόπολη Γερμανίας. Το 2004 ανέλαβε καθήκοντα ως Πρωτοσύγκελος στην Ιερά Μητρόπολη Γαλλίας, υπό τον τότε Μητροπολίτη Γαλλίας Εμμανουήλ. Εξελέγη Μητροπολίτης Αυστρίας και Έξαρχος Ουγγαρίας και Μεσευρώπης από την Ιερά Σύνοδο του Οικουμενικού Πατριαρχείου, στις 3 Νοεμβρίου 2011.
Χειροτονήθηκε από τον Οικουμενικό Πατριάρχη Βαρθολομαίο στον Πατριαρχικό Ναό του Αγίου Γεωργίου στο Φανάρι, στις 30 Νοεμβρίου 2011. Ενθρονίστηκε στον Ιερό Καθεδρικό Ναό της Αγίας Τριάδος Βιέννης, στις 4 Δεκεμβρίου 2011.