Ολοκληρώθηκε από το Eθνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2, που λειτουργεί υπό το συντονισμό του ΕΟΔΥ, η γονιδιωματική ανάλυση σε 892 δείγματα που έχουν επιλεγεί τυχαιοποιημένα ή στοχευμένα και αφορούν στην περίοδο 20 Μαΐου 2021 έως 07 Ιουλίου 2021.
Από τον έλεγχο των 892 δειγμάτων, αναδείχθηκαν συνολικά 703 δείγματα με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος (Variants Of Concern - VOC), και 174 δείγματα με στελέχη υπό παρακολούθηση (Variants Under Monitoring).
Εκ των 703 δειγμάτων με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος, τα 320 αφορούν στο στέλεχος Alpha, 100 αφορούν στο Βeta, 281 αφορούν στο Delta και 2 αφορούν στο Gamma. Εκ των 174 δειγμάτων με στελέχη υπό παρακολούθηση, τα 168 αφορούν στο στέλεχος B.1.1.318 (Variant E484K), 4 αφορούν στο C.36 και 2 αφορούν στο Α.28 (Πίνακας 3).
Από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα έχουν ελεγχθεί στην επικράτεια συνολικά 21.824 δείγματα από εγχώρια κρούσματα. Εξ αυτών 18.908 προέρχονται από τυχαία επιλογή δειγμάτων, 2.183 προέρχονται από στοχευμένη λήψη ή επιλογή δειγμάτων και για 733 δείγματα δεν είναι διαθέσιμος ο τρόπος επιλογής.
Μεταξύ των 18.908 τυχαία επιλεγμένων δειγμάτων στην επικράτεια, τα τέσσερα πιο συχνά στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση που έχουν απομονωθεί είναι το Alpha, με ποσοστό 76,29%, ακολουθούμενο από το B.1.1.318 (Variant
E484K) με ποσοστό 11,20%, το Delta με ποσοστό 0,80% και το Beta με ποσοστό 0,50% (Πίνακας 4). Η διαχρονική εξέλιξη της σχετικής συχνότητας των αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία ανά είδος στελεχών, μέχρι και την εβδομάδα 26 απεικονίζεται στο Διάγραμμα 9.
Από τα 2.183 δείγματα που έχουν ληφθεί ή επιλεγεί στοχευμένα, έχουν βρεθεί 2.021 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση. Από τα δείγματα αυτά, 57,58% αφορούν στο στέλεχος B.1.1.318 (Variant E484K), 18,92% στο Alpha, 10,08% στο Delta, 5,73% στο Beta, 0,18% στο C.36 και 0,09% στο Gamma.
Επιπλέον, έχουν απομονωθεί συνολικά 158 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση ή ενδιαφέροντος από δείγματα εισαγόμενων κρουσμάτων, εκ των οποίων 109 αφορούν στο Alpha, 34 στο Delta, 5 στο Beta, 4 στο Β.1.1.318 (Variant E484K), 2 στο B.1.621 (VOI), 1 στο Eta, 1 στο Kappa, 1 στο C.36, και 1 στο B.1.623.
Όσον αφορά στα στελέχη ενδιαφέροντος που χρήζουν άμεσης λήψης μέτρων ελέγχου επί του παρόντος στη χώρα, η γεωγραφική κατανομή ανά Περιφερειακή Ενότητα παρουσιάζεται στον πίνακα 5.
Πίνακας 3*¥. Απόλυτη και σχετική συχνότητα κρουσμάτων με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος/υπό διερεύνηση/υπό παρακολούθηση ή άλλα στελέχη ενδιαφέροντος του ιού SARS CoV-2 από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα
*Η παρούσα κατανομή δύναται να τροποποιηθεί ανάλογα με τα διαθέσιμα επιδημιολογικά δεδομένα. ¥Καθώς η διαδικασία τυποποιημένης ονοματολογίας των στελεχών ενδιαφέροντος είναι σε εξέλιξη παγκοσμίως, η ονομασία τους είναι δυνατό να τροποποιείται στο χρόνο.
Διάγραμμα 9. Σχετική συχνότητα αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία ανά είδος στελεχών, ανά 15νθήμερο, από την έναρξη της λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS CoV-2 έως 04/07/2021
Σημ.1 Στα “Λοιπά Στελέχη Πιθανού Ενδιαφέροντος” περιλαμβάνονται όλα τα στελέχη του πίνακα 3 εκτός των Β.1.1.7 (Alpha), B.1.1.318 (Variant E484K), B.1.351/501Y.V2 (Beta) και B.1.617.2 (Delta).
Σημ.2 Στα “Άλλα Κυκλοφορούντα Στελέχη” περιλαμβάνονται τα παλαιότερα στελέχη που κυκλοφορούσαν κατά την πρώτη και δεύτερη πανδημική περίοδο και τα οποία δεν φέρουν ανησυχητικές μεταλλάξεις (π.χ. del 69-70, N501Y, E484K, L452R κλπ.) που σχετίζονται με αυξημένη μεταδοτικότητα ή μολυσματικότητα ή διαφυγή ή διαγνωστικά ζητήματα.
Πίνακας 4*¥. Ποσοστό εγχώριων θετικών δειγμάτων για τα τέσσερα συχνότερα στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση του ιού SARS-CoV-2 επί του συνόλου των ελεγχθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία, ανά Περιφέρεια για το 15νθήμερο από 21/06/2021 έως 04/07/2021 και για το χρονικό διάστημα από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα.
*Η παρούσα κατανομή δύναται να τροποποιηθεί ανάλογα με τα διαθέσιμα επιδημιολογικά δεδομένα.
¥Καθώς η διαδικασία τυποποιημένης ονοματολογίας των στελεχών ενδιαφέροντος είναι σε εξέλιξη παγκοσμίως, η ονομασία τους είναι δυνατό να τροποποιείται στο χρόνο.
Σημ. Τα ποσοστά για τις εβδομάδες 25-26 που αντιστοιχούν στις Περιφέρειες Δυτικής Μακεδονίας, Θεσσαλίας, Νοτίου Αιγαίου και Στερεάς Ελλάδας έχουν υπολογιστεί επί συνόλου δειγμάτων < 30.
Πίνακας 5*¥. Απόλυτος αριθμός κρουσμάτων (τυχαία και στοχευμένη δειγματοληψία) με στελέχη αυξημένου ενδιαφέροντος που χρήζουν άμεσης λήψης μέτρων ελέγχου, ανά Περιφερειακή Ενότητα, για το χρονικό διάστημα από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα.
