Προβλήματα στις πτήσεις αεροσκαφών προκάλεσαν οι ισχυροί άνεμοι οι οποίοι είτε «ακύρωσαν» τα δρομολόγια, είτε τα «άλλαξαν».
Συγκεκριμένα, σύμφωνα με πληροφορίες, τα δρομολόγια δύο πτήσεων μετατράπηκαν. Πρόκειται για αεροσκάφη τα οποία επρόκειτο να προσγειωθούν στο αεροδρόμιο «Ν. Καζαντζάκης» κάτι που δεν κατέστη δυνατό και γι' αυτό προσγειώθηκαν στο αεροδρόμιο «Ι. Δασκαλογιάννης».
Παράλληλα, και μία τρίτη πτήση από Αθήνα για Ηράκλειο δεν πραγματοποιήθηκε λόγω των νοτιάδων που πλήττουν το νησί. Τέλος, αεροπλάνο δεν πέταξε από το Ηράκλειο στη Σητεία.